Fotosystem
I vissa fall kan fotosystem I fungera självständigt (s.k. cyklisk fotofosforylering), varvid endast ATP uppstår. Vid cyklisk fotofosforylering återvänder elektronerna från den primära elektronmottagaren via cytokrom b6f-komplexet och plastocyanin till reaktionscentrum. Vid den cykliska fotofosforyleringen bildas inte NADPH och inte heller syre. Den kemiosmotiska ATP-syntesen sker med samma mekanismer i den lineära och den cykliska elektroncykeln.
Valet av elektronrutt beror på halten av ATP och NADPH i kloroplasten. Då fotosystem II och I fortgår samtidigt strömmar elektroner lineärt från fotosystem II till fotosystem I, varvid ATP och NADPH bildas i ungefär lika stora mängder. Koldioxidassimilationen i Calvins cykel använder emellertid mer ATP än NADPH. Detta leder till att halten NADPH stiger i kloroplasten. På grund av detta övergår fotofosforyleringen tillfälligt till den cykliska rutten tills halten ATP är tillräckligt hög. Samtidigt produceras ATP för cellens andra reaktioner.
