Konfokaalimikroskopia
Konfokaalimikroskopian optiset komponentit ovat periaatteessa samat kuin tavallisessa fluoresenssimikroskoopissa, ja konfokaalimikroskooppia käytetäänkin tyypillisesti fluoresenssioptiikan kanssa. Fluoresenssimikroskoopista poiketen valonlähteenä toimii laser, joka kohdennetaan pieneksi ja kirkkaaksi pisteeksi haluttuun syvyystasoon näytettä. Lasersäde pyyhkii nopeasti näytteen pintaa, ja tarkasteltavasta tasosta emittoituva fluoresenssi tarkentuu apertuuriin (pinhole aperture), josta valo siirtyy detektorille.
Koska tarkennustason ylä- ja alapuolelta tuleva valonsäteet eivät pääse apertuuriin, ne eivät pääse mukaan muodostuvaan kuvaan. Tällöin muodostuvan kuvan terävyys on tavallista mikroskooppikuvaa parempi, ja näytettä voidaan tarkastella ohuina optisina leikkeinä eri tasoilla. Optisten leikkeiden perusteella koko tarkasteltavasta kohteesta voidaan tietokoneella rekonstruoida kolmiulotteinen malli.
